En este trabajo se propone un algoritmo para analizar las trayectorias de los peces en el interior de escalas de hendidura vertical, construcciones hidráulicas que permiten a los peces sortear estructuras como presas que obstaculizan los procesos naturales en los ríos. Con la técnica propuesta se pretende estudiar el comportamiento de los peces en el interior de las escalas con el fin de conocer los requisitos de los animales e incrementar la eficacia de las mismas. La técnica propuesta calcula la posición del pez en cada instante a partir de una secuencia de imágenes adquiridas con cámaras de video utilizando Redes de Neuronas Artificiales (RNAs) y técnicas de visión artificial. Para evaluar la técnica propuesta, se han realizado diferentes ensayos en un modelo de escala de hendidura vertical de tamaño 1:1 y con peces vivos.